Главное в материале
- GenoMorph использует 3D-морфологию, сравнительную геномику и биологию развития для поиска генов-мишеней
- Выявлено около 2300 потенциальных мишеней редактирования ДНК для черепно-лицевой морфологии додо
- Создана система доставки генных инструментов в эмбрионы птиц с помощью липидных наночастиц
Новая ИИ-платформа для де-экстинкции
Компания Colossal Biosciences объявила о запуске ИИ-платформы GenoMorph, предназначенной для ускорения проектов по возвращению вымерших видов. Платформа сочетает продвинутую 3D-морфологию, сравнительную геномику и биологию развития, чтобы определять гены, которые можно редактировать в проектах с ограниченным объёмом генетических данных. Первым применением стал проект по возвращению птицы додо, для которой доступно мало геномов.
Проблема нехватки древней ДНК
По данным компании, для проекта по додо доступен только один геном, тогда как для проекта по шерстистому мамонту удалось получить около 100 геномов. ДНК мамонта сохраняется лучше благодаря холодному климату, в отличие от тропиков, где жил додо. Генеральный директор и сооснователь Colossal Бен Лэм объяснил TechCrunch, что обычно учёные сравнивают множество геномов, чтобы понять, какие генетические различия отвечают за те или иные признаки, но с древней ДНК вымерших видов такой возможности нет.
Как устроена GenoMorph
Для создания платформы, по словам Лэмма, компания собрала данные развития кур, перепелов, уток и голубей, объединив их с генетической информацией и 3D-измерениями черепов более чем 70 видов птиц. На разработку ушло более года. ИИ определяет, какие участки ДНК активны при формировании клюва и лицевых структур у разных птиц, и на основе этого предсказывает, какие генетические «переключатели» могли дать додо его характерный облик. Лэмм сравнил платформу с «картой сокровищ для генома додо»: вместо перебора множества возможных генетических различий GenoMorph помогает находить только значимые. Уже выявлено около 2300 перспективных мишеней редактирования ДНК для черепно-лицевой морфологии додо, которые можно проверить в лаборатории.
Доставка генных инструментов в эмбрионы
Компания также разработала систему, использующую липидные наночастицы для доставки инструментов редактирования генов непосредственно в развивающиеся эмбрионы птиц. Это позволяет наблюдать влияние генетических изменений на развитие птицы, не дожидаясь полного цикла размножения, при котором птицы должны достичь половой зрелости. Лэмм подчеркнул, что учёным всё равно нужно проверять, создают ли такие правки нужные физические признаки.
Прогресс в проекте по додо
Одновременно Colossal сообщила, что колония никобарского голубя — ближайшего живущего родственника додо — выросла до 36 особей, и компания успешно создала ключевые клетки, из которых формируются яйцеклетки и сперматозоиды. По словам Лэмма, эти клетки — критическая часть стратегии по созданию птиц с признаками додо. Следующий шаг — проверить предсказания GenoMorph в лаборатории.
Безопасность и инвестиции
Отвечая на вопрос о безопасности такого редактирования генов, Лэмм сказал, что цель технологии вроде GenoMorph — сделать генную инженерию «более точной, контролируемой и проверяемой». По его словам, платформа сама не редактирует гены, а лишь помогает определить, какие изменения стоит исследовать: «Выявление потенциальной правки не означает, что мы сразу вносим её в животное или считаем её безопасной». Кроме того, инвестор Colossal и основатель XPRIZE Питер Диамандис в среду объявил о создании нового венчурного фонда NeoGenesis Capital для поддержки компаний, использующих платформу программируемой биологии Colossal в сферах здравоохранения, сельского хозяйства и охраны природы.
